L'architecte militaire du Roi Soleil a su exploiter au mieux les caractéristiques de défense naturelle du site, pour réaliser la Citadelle, sur onze hectares, à 120 m au dessus de la capitale régionale. La Citadelle abrite aujourd’hui de nombreux centres d’intérêt dont trois musées de France dédiés à l’histoire, la mémoire et la biodiversité animale.

Le Musée comtois propose une découverte de la Franche-Comté de ses hommes, paysages, métiers et traditions. Sa vocation ethnographique s’exprime dans dix-sept salles illustrant en une série de tableaux la vie des hommes et des femmes du XIXe et du début du XXe siècles.

Le Musée de la résistance et de la déportation, parmi les plus complets et les plus importants de France, offre un témoignage poignant sur cette période sombre de l’Histoire du XXe siècle. Plus de 15 000 objets et documents, dont de bouleversantes photographies et dessins originaux, évoquent l’héroïsme des résistants dans un département occupé et le sort réservé à ceux qui partaient pour un voyage sans retour outre-Rhin.

Unique et inattendu en ce lieu hors du commun, le Museum regroupe jardin zoologique, noctarium, insectarium, petite ferme ainsi qu’un aquarium. Nulle part ailleurs en France, il est possible de voir réunies sur un même site autant de variété d’animaux.

Le circuit des remparts comporte treize stations avec, à chaque fois, la découverte d’une pièce maîtresse de la forteresse et un coup d’œil sur un quartier historique de la ville ou sur l’une des collines qui l’entourent. Cette promenade à vivre avec la complicité d’un audio guide se poursuit logiquement par la visite de l’Espace Vauban dédié à l’œuvre et à la vie du plus génial des architectes militaires français.