En 2008, plusieurs travaux de restauration sont d’ores et déjà en cours : les tours bastionnées des Cordeliers et de Chamars ainsi que l’Arsenal de la Citadelle, classés monuments historiques.

Dès l’été 2009, un souterrain de 110 mètres de long reliant le front Saint-Etienne au front royal dans la Citadelle sera restauré et permettra aux visiteurs de découvrir de manière insolite les lieux où circulaient les soldats entre les deux fronts. Le Hangar aux manœuvres, au cœur de la Citadelle, fera également l’objet de travaux de restauration afin d’accueillir de futures expositions temporaires.

Des animations sont organisées tout au long de l’été 2008 autour du patrimoine Vauban à Besançon :

. promenades théâtralisées du 11 juillet au 21 août dans les lieux prestigieux de la capitale comtoise,
. découverte de l’histoire de la Citadelle avec des comédiens en costumes d’époque du 20 juillet au 17 août,
. itinéraires balisés pour découvrir le patrimoine Vauban à Besançon,
. projection du magazine C’est pas sorcier « les fortifications de Vauban », espace lecture et jeux de construction pour les enfants sur le thème de la fortification bastionnée du 10 juillet au 31 août
. et également deux expositions sur le thème de Vauban au musée du Temps…